sábado, 20 de febrero de 2021

Estudio Universidad UC DAVIS Akita Americano y Japonés : Primera parte

 Por su interés para los VERDADEROS aficionados y amantes de la raza, paso a traducir el Estudio de la Universidad UC Davis sobre el Akita y su diversidad genética. Aclaro que no es mi opinión,sino la del conjunto de Biólogos y Veterinarios que lo han realizado. Para cualquier duda,o si bien alguno de los lectores considera tener una opinión diferente a ellos, considero interesante lo remitan a la Universidad,que gustosamente aceptarán sus conocimientos. Por otro lado,el estudio sigue abierto. Cualquiera puede incluir sus akitas en él,con el fin de mejorarlo....si es que hay interés. Ojalá lo haya. Empiezo.


 

"Comprobación de la Diversidad Genética en Akitas"

El "Veterinary Genetics Laboratory"(VGL) en colaboración con el DR Niels C. Pedersen y su equipo técnico han desarrollado un panel de marcadores que determinarán la diversidad genética del akita a través del Genoma y el Antigeno Leucocito Canino (DLA) de las Regiones I y II . Este panel será útil para los criadores que deseen mejorar la diversidad genética del akita pensando el bienestar genético de la raza a largo plaza( N del T...me temo que no habrá muchos)

 El Test de  Diversidad Genética del Akita está muy bien determinado,y pensamos que todos los alelos de los grupos STR LOCI y el DLA de las Regiones I y II han sido identificados.Si aparece alguno nuevo,será muy poco probable. Añadiremos todos los nuevos que aparezcan,para ajustar el panel,en caso que ocurra. Hemos confirmado que el Akita existe en dos variedades,Japones(JKC) y Americano (AKC). Los cruces de ambos han sido también determinados y caracterizados genéticamente como intermedios.Para Septiembre de 2018,hemos testados 524 ejemplares de las tres variedades ,y los resultados han sido actualizados.

El precio del test es de 80 dólares, y se reduce a 70 si se combina con un test de diagnóstico de enfermedades genéticas.

 Los resultados obtenidos:

Panel Corto STR Loci :33 alelos diferentes fueron aislados del genoma para determinar la diversidad de cada ejemplar y asimismo en comparativa con la raza. Los alelos hereditarios de cada ejemplar se muestran gráficamente en grado de heterozigosidad.Se estima también la frecuencia del alelo en su grado en la raza.

Haplotipos DLA :el STR Loci conectado con los genes de clase I y II fueron utilizados para determinar las diferencias que regulan la respuesta inmune  y el autoreconocimiento. Estos genes,unidos a factores de naturaleza exógena son los responsables de las enfermedades autoinmunes.

Relación Interna: los valores IR son una medida de diversidad genética dentro de un individuo que considera tanto la heterogozisidad  de alelos de cada STR Loci y su frecuencia relativa en la población. De esta forma,el IR evalúa la heterogozisidad y heterogozisidad y los alelos no comunes sobre los alelos comunes .Los valores IR son únicos en cada ejemplar y no pueden ser comparados entre perros. Dos perros pueden tener idénticos valores IR pero ser muy diferentes genéticamente entre sí.


 

INTRODUCCION

EL Akita es Originario de laTierras Altas del Norte de Japón (Isla de Honshu).A los largo de los últimos 70 años,ha sido separado a través de la cría ,y de alguna forma también de la geografía,en dos razas o variedades.Ambas "razas" provienen de una única población fundadora. Durante la II Guerra Mundial,y en trance de desaparecer,muchos akitas fueron cruzados con otras razas en un intento de salvarlos de las órdenes del Gobierno de eliminarlos en Japón.

El Akita Americano comenzó tras la Guerra con 166 ejemplares de todo tipo y color registrados en el Akita Club en 1966. Cuando el libro de Registro se transfirió al AKC en 1972,1865 akitas se consideraron el stock fundacional.Más akitas fueron importados y registrados en el AKC hasta 1974,momento en que el Registro de ejemplares importados se cerró(hasta 1992 que reabrió).


 

Mientras tanto,en Japón ,despues de 1931,después de ser considerado Tesoro Nacional,se realizaron esfuerzos adicionales ,a través de seleccionar líneas,para restaurar/preservar el akita a su standard original (permitiendo solo tres colores de origen). Algunas de esas lineas fueron utilizadas también en el akita americano, en Estados Unidos,Europa y Oceanía. Debido a que los criadores americanos y japoneses perseguían diferentes objetivos,el país de origen pidio a la FCI separar las razas. Algunos defienden cruzar los dos tipos,otros se oponen vehementemente. Algunos proponen recuperar la antigua raza,otros and prioridad a una variedad sobre la otra,otros creen ue en realidad ninguna de las dos variedades se correspone con el verdadero perro original de Honshu.

La información genética utilizada proviene de 524 ejemplares de los que se tomó en ADNe incluye akitas americanos,japoneses y cruces de ambos de todo el Mundo.Creemos que la población utilizada es una razonable muestra de la variedad de la raza,para determinar diversidad genética y relación genética entre las variedades.

EL TEST DE DIVERSIDAD GENETICA Y LO QUE NOS DICE

A Genética Poblacional basada en 33 STR Loci en 25 Cromosomas 

Los marcadores STR son altamente polimórficos y tiene gran poder para determinar diferencias genéticas entre individuos y razas.El panel de test de rutina tiene 33 STRs que es lo recomendado para la determinación de parentaje universal de perros domésticos por la Sociedad Internacional de Genetica Animal(ISAG) con marcadores adicionales desarrollados por nuestro Laboratorio para propósitos forenses.

La diversidad de alelos en cada STR Loci y su frecuencia en la población fueron utilizados para determinar la relación genética y diversidad de akitas americanos ,japoneses y mezcla de ambos en Todo el Mundo.Las frecuencias de alelos  difieren en alguna medida entre americanos y japoneses,y algunos son específicos para Americano o Japonés.De todos modos,eso ocurre en una frecuencia muy baja,y esmuy  posible que se encuentren si aumentamos el número de ejemplares en la muestra poblacional.Las frecuencias de Alelos muestran que los cruces tienen son verdaderos cruces de ambos,pero más cercanos al americano que al japonés.

 B Establecimiento Genético de variedades de akita usando la frecuencia genómica de ALELOS STR

 1-los datos de frecuencia de alelos obtenidos del panel de 33 STR pueden ser utilizados para un standard genético basado en la hererogozisidad. Los Akitas japoneses tienen una proporción de 6,30 Alelos/Loci ,los americanos 6,64 alelos/Loci . Las mezclas, una proprorción de 5,36 Alelos/Loci . El mayor número de alelos/Locus nos indica que el akita americano moderno tiene más diversidad genética que el japonés.

 El akita americano tiene una proporción de 3,03 alelos/loci efectivos ,mientras el japonés tiene 2,41 y las mezclas 2,67. Los alelos efectivos son la proporción que contribuye mas  a la heterogozisidad. El menor número en el japonés indica una menor diversidad generica,derivada de una base de ejemplares fundadores menor,probablemente,derivada de la reconstitución de su variedad(ver haplotipos DLA).

La heterogozisidad  observada(HO) y la esperada(HE) pueden ser utilizadas para calcular un valor (F) que es la estimación de inbreding en una población .Un valor de 0 en F indica que la población está en equilibrio Hardy-Weyding. Un valor positivo indica que hay una subpoblación de individuos con mayor coeficiente de inbreeding que la población total,y cuanto mayor el valor,más alto el número de la población cerrada en inbreeding.El HO para el akita americano es de 0,587 , y para el japonés, 0,535 . La HE si las poblaciones estuvieran en equilibrio fue de 0,622 para el akita americano y de 0,543 para el akita japonés . De este modo,el porcentaje de inbreeding fue mayor en el akita americano . Aunque el akita americano tiene mayor diversidad genética que el japonés,su coeficiente de inbreeding es mayor . Por supuesto ,las mezclas tiene los valores más bajos en ambos.

 Table 2. F-Statistics of Akitas using 33 STR loci on 25 chromosomes




 

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